根际微生物群落结构测试
检测项目
多样性分析:
- Alpha多样性:Shannon指数(H'≥3.0)、丰富度(物种数≥100)(参照ISO11063)
- Beta多样性:Bray-Curtis距离(相似度指数≤0.5)、Jaccard指数(差异度≥0.7)
- 细菌群落:16SrRNA基因丰度(相对丰度误差±5%)
- 真菌群落:JianCe区域序列分析(检出限1pg/μL)
- 古菌群落:mcrA基因定量(拷贝数≥10^3/g土壤)
- 氮循环基因:amoA丰度(qPCRCt值≤30)
- 碳代谢基因:cbbL表达水平(相对定量±10%)
- 脱氢酶活性:TTC还原法(活性单位≥20μgTF/g/h)
- 磷酸酶活性:pNPP法(比活性≥0.5μmol/min/g)
- 微生物碳含量:氯仿熏蒸法(检测限0.1mg/g)
- 微生物氮含量:Kjeldahl法(精度±0.01%)
- 时间序列变化:群落相似度指数Δt(变化率≥5%/月)
- 空间分布分析:三维梯度采样(分辨率1cm^3)
- 植物病原真菌:Fusariumspp.定量(拷贝数≥10^2/g)
- 抗生素抗性基因:ARGs筛查(检出限0.1%)
- 有机酸谱:GC-MS定量(相对标准差≤5%)
- 挥发性化合物:HS-SPME法(检出限1ppb)
- 重金属胁迫响应:群落耐受指数(MTI≥0.8)
- pH适应性:最适pH范围(6.0-7.5)
- 菌根真菌定殖率:根段镜检(定殖率≥30%)
- 根际细菌互作:共现网络分析(连接数≥50)
检测范围
1.农田作物根际土壤:覆盖小麦、玉米根际,重点监测农药残留对微生物多样性的影响
2.森林生态系统根际:针叶林和阔叶林根部样本,侧重生物多样性变化与碳储存功能
3.湿地植物根际沉积物:芦苇、香蒲根部区域,检测淹水胁迫下群落结构演变
4.草地牧场根际土壤:牧草根圈样本,关注放牧压力对微生物功能基因的影响
5.果园根际环境:果树如苹果、柑橘根部,重点评估肥料施用引起的群落失衡
6.城市绿地根际样本:公园植被根部,监测重金属污染胁迫响应
7.沙漠植被根际土壤:耐旱植物如梭梭根部,分析干旱适应机制
8.水生植物根际沉积物:荷花、水草根部,侧重厌氧环境下微生物代谢
9.温室栽培根际介质:无土栽培基质,检测人工环境群落稳定性
10.退化土壤修复根际:复垦区域根部样本,评估恢复措施对微生物功能的影响
检测方法
国际标准:
- ISO11063:2012土壤微生物DNA提取与定量方法
- ISO14240-1:1997土壤微生物生物量测定熏蒸提取法
- ISO16198:2015土壤质量植物测试评估微生物活性
- GB/T23739-2009土壤微生物群落分析方法
- GB/T32740-2016土壤酶活性测定通用方法
- GB/T36690-2018微生物多样性高通量测序规范
检测设备
1.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量20Breads/run,准确率Q30≥85%)
2.实时荧光定量PCR仪:Bio-RadCFX96Touch(温度梯度±0.1°C,检测通道6个)
3.全自动酶标仪:TecanInfiniteM200Pro(波长范围230-1000nm,精度±1%)
4.DNA提取工作站:QiagenQIAcubeHT(处理量96样本/批次,回收率≥95%)
5.超低温离心机:Eppendorf5427R(转速15000rpm,温控-20°C)
6.气相色谱质谱联用仪:Agilent8890GC/5977BMS(分辨率0.1amu,扫描范围10-1050m/z)
7.荧光显微镜:OlympusBX53(放大倍数1000x,荧光通道4个)
8.土壤呼吸测定系统:PPSystemsCIRAS-3(CO2检测限1ppm,流量范围0-1L/min)
9.自动生化分析仪:Hitachi7180(检测速度800tests/h,精度CV≤2%)
10.微生物培养箱:MemmertIPP110(温度范围5-60°C,均匀度±0.5°C)
11.超纯水系统:MilliporeMilli-QIQ7000(电阻率18.2MΩ·cm,产水量2L/h)
12.冷冻干燥机:LabconcoFreeZone2.5(真空度<0.1mbar,干燥时间<24h)
13.振荡培养器:ThermoScientificMaxQ6000(转速50-300rpm,容量25L)
14.核酸浓度测定仪:DeNovixDS-11(检测范围0.4-27,500ng/μL,精度±1%)
15.环境模拟舱:BinderKBF720(温湿度控制范围5-50°C/10-98%RH,光照可调)
北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。